Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A4Q6P1M0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A4Q6P1M0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A4Q6P1M0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms