Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATL3Q6DD88 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATL3Q6DD88 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATL3Q6DD88 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATL3Q6DD88 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATL3Q6DD88 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms