Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD40Q6AI12 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ANKRD40Q6AI12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ANKRD40Q6AI12 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ANKRD40Q6AI12 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ANKRD40Q6AI12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms