Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
E4F1Q66K89 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E4F1Q66K89 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
E4F1Q66K89 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
E4F1Q66K89 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E4F1Q66K89 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E4F1Q66K89 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms