Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01545Q5VT33 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01545Q5VT33 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01545Q5VT33 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01545Q5VT33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms