Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CROCCQ5TZA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CROCCQ5TZA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CROCCQ5TZA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CROCCQ5TZA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCQ5TZA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms