Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM78Q5T7P6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM78Q5T7P6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM78Q5T7P6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms