Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD3Q5T2D3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD3Q5T2D3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD3Q5T2D3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD3Q5T2D3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUD3Q5T2D3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms