Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM41BQ5BJD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM41BQ5BJD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM41BQ5BJD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM41BQ5BJD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM41BQ5BJD5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM41BQ5BJD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM41BQ5BJD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM41BQ5BJD5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM41BQ5BJD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM41BQ5BJD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM41BQ5BJD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms