Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDK2Q58EX2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDK2Q58EX2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDK2Q58EX2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDK2Q58EX2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDK2Q58EX2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms