Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TPRNQ4KMQ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TPRNQ4KMQ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TPRNQ4KMQ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPRNQ4KMQ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TPRNQ4KMQ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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