Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP5B1Q2VPB7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AP5B1Q2VPB7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP5B1Q2VPB7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP5B1Q2VPB7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP5B1Q2VPB7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms