Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NECTIN1Q15223 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NECTIN1Q15223 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NECTIN1Q15223 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NECTIN1Q15223 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NECTIN1Q15223 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NECTIN1Q15223 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NECTIN1Q15223 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NECTIN1Q15223 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
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