Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF1Q13905 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAPGEF1Q13905 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF1Q13905 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF1Q13905 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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