Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIK3Q13003 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIK3Q13003 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIK3Q13003 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK3Q13003 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIK3Q13003 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK3Q13003 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK3Q13003 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK3Q13003 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK3Q13003 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK3Q13003 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK3Q13003 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK3Q13003 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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