Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BNIP1Q12981 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNIP1Q12981 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BNIP1Q12981 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP1Q12981 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP1Q12981 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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