Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 FN1-213ENST00000456923 3720 ntTSL 26.56□□□□□ -1.369e-9■■■■■ 34.4
ILF3Q12906 FN1-224ENST00000492816 9171 ntTSL 55.55□□□□□ -1.529e-9■■■■■ 34.4
ILF3Q12906 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 34.2
ILF3Q12906 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 34.2
ILF3Q12906 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.252e-10■■■■■ 34.2
ILF3Q12906 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.332e-10■■■■■ 34.2
ILF3Q12906 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.772e-10■■■■■ 34.2
ILF3Q12906 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 34.2
ILF3Q12906 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 34.2
ILF3Q12906 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 34.2
ILF3Q12906 MED15-217ENST00000445987 590 ntTSL 415.97■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 ZNF146-204ENST00000587285 571 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.162e-11■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 TK1-206ENST00000592126 631 ntTSL 319.21■□□□□ 0.672e-12■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.472e-12■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 TK1-202ENST00000586613 631 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-12■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.32e-12■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.052e-12■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-12■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.442e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.372e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-206ENST00000602479 752 ntTSL 321.67■■□□□ 1.062e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-207ENST00000602499 744 ntTSL 221.67■■□□□ 1.062e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.572e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-203ENST00000602291 766 ntTSL 39.53□□□□□ -0.882e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-210ENST00000602762 340 ntTSL 37.79□□□□□ -1.162e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-204ENST00000602303 654 ntTSL 56.84□□□□□ -1.312e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 UBE2E3-212ENST00000602888 499 ntTSL 24.67□□□□□ -1.662e-18■■■■■ 34.1
ILF3Q12906 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 34
ILF3Q12906 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 34
ILF3Q12906 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 516.45■□□□□ 0.224e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 214.48□□□□□ -0.094e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.145e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.154e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.165e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 ARID4B-211ENST00000474953 3463 ntTSL 212.83□□□□□ -0.364e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.454e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.754e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.84e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -14e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 ARID4B-206ENST00000444620 1660 ntTSL 58.52□□□□□ -1.054e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.114e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 46.87□□□□□ -1.314e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 PPIH-206ENST00000461351 527 ntTSL 36.26□□□□□ -1.414e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 ARID4B-213ENST00000494543 453 ntTSL 35.92□□□□□ -1.464e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 METAP2-206ENST00000549136 388 ntTSL 25.63□□□□□ -1.514e-10■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 MREG-204ENST00000439791 576 ntTSL 45.59□□□□□ -1.514e-10■■■■■ 33.9
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ILF3Q12906 MREG-203ENST00000424992 560 ntTSL 54.29□□□□□ -1.724e-10■■■■■ 33.9
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ILF3Q12906 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 412.41□□□□□ -0.426e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 TBC1D5-218ENST00000445294 623 ntTSL 211.92□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 311.56□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 33.9
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ILF3Q12906 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 510.4□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 310.39□□□□□ -0.756e-8■■■■■ 33.9
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ILF3Q12906 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.16e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.126e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.436e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 46.08□□□□□ -1.446e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 46.08□□□□□ -1.446e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 TBC1D5-230ENST00000507877 578 ntTSL 44.53□□□□□ -1.686e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 TBC1D5-213ENST00000434420 386 ntTSL 43.68□□□□□ -1.826e-8■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 SMAD5-209ENST00000514777 588 ntTSL 313.06□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.324e-6■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 SMAD5-204ENST00000507637 638 ntTSL 24.88□□□□□ -1.634e-6■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.664e-6■■■■■ 33.9
ILF3Q12906 AC018552.2-201ENST00000563062 804 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.842e-10■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 RICTOR-206ENST00000510711 3126 ntTSL 28.82□□□□□ -19e-9■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 RICTOR-209ENST00000514735 686 ntTSL 37.04□□□□□ -1.289e-9■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 RICTOR-208ENST00000513566 1762 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.399e-9■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.899e-9■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 RICTOR-207ENST00000511516 7312 ntTSL 1 (best)2.6□□□□□ -1.999e-9■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.069e-9■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 SRP68-211ENST00000592704 1941 ntTSL 225.74■■□□□ 1.712e-7■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 ACAT2-202ENST00000467951 856 ntTSL 316.14■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 33.8
ILF3Q12906 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.963e-13■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 SIPA1L1-210ENST00000555652 379 ntTSL 323.33■■□□□ 1.331e-11■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 SIPA1L1-212ENST00000555989 569 ntTSL 418.96■□□□□ 0.631e-11■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 SIPA1L1-204ENST00000553453 521 ntTSL 518.89■□□□□ 0.611e-11■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 SIPA1L1-214ENST00000556780 591 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-11■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 SIPA1L1-216ENST00000557151 744 ntTSL 316.35■□□□□ 0.211e-11■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 SIPA1L1-213ENST00000556408 903 ntTSL 39.45□□□□□ -0.91e-11■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 SIPA1L1-206ENST00000554362 552 ntTSL 53.28□□□□□ -1.881e-11■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 SIPA1L1-205ENST00000554126 576 ntTSL 51.59□□□□□ -2.151e-11■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-10■■■■■ 33.7
ILF3Q12906 ANKRD17-205ENST00000513908 852 ntTSL 210.37□□□□□ -0.751e-18■■■■■ 33.6
ILF3Q12906 ANKRD17-209ENST00000560507 563 ntTSL 33.69□□□□□ -1.821e-18■■■■■ 33.6
ILF3Q12906 KPNA1-210ENST00000494339 1923 ntTSL 220.02■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 33.5
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