Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNH2Q12809 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH2Q12809 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNH2Q12809 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNH2Q12809 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH2Q12809 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
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