Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLFN5Q08AF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLFN5Q08AF3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLFN5Q08AF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLFN5Q08AF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLFN5Q08AF3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLFN5Q08AF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLFN5Q08AF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLFN5Q08AF3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLFN5Q08AF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SLFN5Q08AF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLFN5Q08AF3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLFN5Q08AF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLFN5Q08AF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLFN5Q08AF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms