Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 YBL086CYBL086C 1401 nt9.61□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 IZH4YOL101C 939 nt9.6□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 POP4YBR257W 840 nt9.6□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 YMR210WYMR210W 1350 nt9.6□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 ATG29YPL166W 642 nt9.59□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 UBS1YBR165W 834 nt9.59□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 NUP57YGR119C 1626 nt9.59□□□□□ -0.87
BUD20Q08004 RAD23YEL037C 1197 nt9.58□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt9.58□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 DBR1YKL149C 1218 nt9.58□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt9.58□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 YLR111WYLR111W 333 nt9.57□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 SPC24YMR117C 642 nt9.57□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 SHE9YDR393W 1371 nt9.57□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 ENT5YDR153C 1236 nt9.56□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 BTT1YDR252W 450 nt9.56□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 CSL4YNL232W 879 nt9.56□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 NCE102YPR149W 522 nt9.56□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 SHY1YGR112W 1170 nt9.55□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 OMA1YKR087C 1038 nt9.55□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 ERV41YML067C 1059 nt9.55□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 PCL1YNL289W 840 nt9.55□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 YPL251WYPL251W 303 nt9.55□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 ARR1YPR199C 885 nt9.55□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 YAT1YAR035W 2064 nt9.54□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 RBG2YGR173W 1107 nt9.54□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 YMR226CYMR226C 804 nt9.54□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 YPL068CYPL068C 882 nt9.54□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 RMD5YDR255C 1266 nt9.53□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt9.53□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt9.53□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 BTS1YPL069C 1008 nt9.53□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 SLM4YBR077C 489 nt9.53□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 ZRT3YKL175W 1512 nt9.52□□□□□ -0.88
BUD20Q08004 LEU9YOR108W 1815 nt9.52□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.52□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 MRPS8YMR158W 468 nt9.52□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 ISR1YPR106W 1332 nt9.52□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 YHR145CYHR145C 357 nt9.51□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 MOB1YIL106W 945 nt9.51□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 GTR1YML121W 933 nt9.51□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 TSR3YOR006C 942 nt9.51□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 POS5YPL188W 1245 nt9.51□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 RIB3YDR487C 627 nt9.5□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 MAD2YJL030W 591 nt9.5□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 FIP1YJR093C 984 nt9.5□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 PCD1YLR151C 1023 nt9.5□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 YMR144WYMR144W 1029 nt9.5□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 IDP3YNL009W 1263 nt9.5□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 BRR1YPR057W 1026 nt9.5□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 UGA4YDL210W 1716 nt9.5□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 CLB5YPR120C 1308 nt9.5□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 SCEIQ0160 708 nt9.49□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 SAM1YLR180W 1149 nt9.49□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 DCP1YOL149W 696 nt9.49□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 BRL1YHR036W 1416 nt9.48□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 UFO1YML088W 2007 nt9.48□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 YCR049CYCR049C 447 nt9.48□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 ELO1YJL196C 933 nt9.48□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 TOA2YKL058W 369 nt9.48□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 SDS22YKL193C 1017 nt9.48□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 NDL1YLR254C 570 nt9.48□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.48□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 YDR029WYDR029W 315 nt9.47□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 YJL067WYJL067W 351 nt9.47□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 RSC4YKR008W 1878 nt9.47□□□□□ -0.89
BUD20Q08004 UBC5YDR059C 447 nt9.46□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 BI2Q0110 1272 nt9.46□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 ERV29YGR284C 933 nt9.46□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 END3YNL084C 1050 nt9.46□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 YOL150CYOL150C 312 nt9.46□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 FCY21YER060W 1587 nt9.46□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 EDC1YGL222C 528 nt9.45□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 FRE6YLL051C 2139 nt9.45□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 YMR103CYMR103C 363 nt9.45□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 SPG5YMR191W 1122 nt9.45□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 VAC17YCL063W 1272 nt9.44□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 YDR541CYDR541C 1035 nt9.44□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 LSB5YCL034W 1065 nt9.44□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 VHS2YIL135C 1311 nt9.44□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 MEP3YPR138C 1470 nt9.44□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 GND2YGR256W 1479 nt9.43□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 SPR1YOR190W 1338 nt9.43□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 CCE1YKL011C 1062 nt9.43□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 URA6YKL024C 615 nt9.43□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 ARL3YPL051W 597 nt9.42□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.41□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.41□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 RPC53YDL150W 1269 nt9.41□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 SSP2YOR242C 1116 nt9.41□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 YLH47YPR125W 1365 nt9.4□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 YDL121CYDL121C 450 nt9.4□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.4□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 TAP42YMR028W 1101 nt9.4□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 YPR027CYPR027C 834 nt9.4□□□□□ -0.9
BUD20Q08004 GND1YHR183W 1470 nt9.4□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 ERJ5YFR041C 888 nt9.39□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 MRPL24YMR193W 777 nt9.39□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 SLZ1YNL196C 897 nt9.39□□□□□ -0.91
BUD20Q08004 SMM1YNR015W 1155 nt9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms