Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUD4Q01804 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTUD4Q01804 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OTUD4Q01804 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD4Q01804 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD4Q01804 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD4Q01804 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD4Q01804 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUD4Q01804 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
OTUD4Q01804 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTUD4Q01804 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUD4Q01804 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTUD4Q01804 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms