Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1BQ01064 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE1BQ01064 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE1BQ01064 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE1BQ01064 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE1BQ01064 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE1BQ01064 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms