Protein–RNA interactions for Protein: P98179

RBM3, RNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3P98179 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBM3P98179 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBM3P98179 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBM3P98179 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBM3P98179 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBM3P98179 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBM3P98179 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBM3P98179 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBM3P98179 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBM3P98179 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBM3P98179 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBM3P98179 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBM3P98179 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBM3P98179 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBM3P98179 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBM3P98179 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBM3P98179 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBM3P98179 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBM3P98179 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBM3P98179 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBM3P98179 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBM3P98179 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBM3P98179 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBM3P98179 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBM3P98179 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBM3P98179 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBM3P98179 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBM3P98179 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBM3P98179 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBM3P98179 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBM3P98179 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBM3P98179 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBM3P98179 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBM3P98179 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBM3P98179 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBM3P98179 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBM3P98179 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBM3P98179 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBM3P98179 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBM3P98179 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBM3P98179 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBM3P98179 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBM3P98179 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RBM3P98179 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBM3P98179 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBM3P98179 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBM3P98179 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBM3P98179 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBM3P98179 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBM3P98179 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBM3P98179 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBM3P98179 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBM3P98179 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBM3P98179 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBM3P98179 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBM3P98179 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBM3P98179 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBM3P98179 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBM3P98179 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBM3P98179 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBM3P98179 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBM3P98179 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBM3P98179 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBM3P98179 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBM3P98179 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBM3P98179 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBM3P98179 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBM3P98179 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBM3P98179 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBM3P98179 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBM3P98179 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBM3P98179 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RBM3P98179 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBM3P98179 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBM3P98179 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBM3P98179 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBM3P98179 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBM3P98179 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBM3P98179 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBM3P98179 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBM3P98179 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBM3P98179 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBM3P98179 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBM3P98179 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBM3P98179 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBM3P98179 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBM3P98179 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBM3P98179 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBM3P98179 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBM3P98179 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBM3P98179 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBM3P98179 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBM3P98179 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBM3P98179 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBM3P98179 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBM3P98179 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBM3P98179 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBM3P98179 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBM3P98179 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBM3P98179 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms