Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FGD1P98174 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
FGD1P98174 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FGD1P98174 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
FGD1P98174 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FGD1P98174 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FGD1P98174 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
FGD1P98174 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FGD1P98174 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FGD1P98174 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FGD1P98174 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FGD1P98174 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FGD1P98174 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FGD1P98174 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FGD1P98174 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FGD1P98174 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FGD1P98174 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FGD1P98174 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FGD1P98174 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FGD1P98174 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FGD1P98174 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FGD1P98174 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
FGD1P98174 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FGD1P98174 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FGD1P98174 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FGD1P98174 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FGD1P98174 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FGD1P98174 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FGD1P98174 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FGD1P98174 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FGD1P98174 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
FGD1P98174 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FGD1P98174 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FGD1P98174 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
FGD1P98174 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FGD1P98174 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FGD1P98174 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FGD1P98174 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
FGD1P98174 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FGD1P98174 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FGD1P98174 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FGD1P98174 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FGD1P98174 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FGD1P98174 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FGD1P98174 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FGD1P98174 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
FGD1P98174 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FGD1P98174 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FGD1P98174 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FGD1P98174 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FGD1P98174 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
FGD1P98174 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FGD1P98174 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FGD1P98174 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FGD1P98174 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FGD1P98174 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FGD1P98174 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FGD1P98174 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FGD1P98174 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FGD1P98174 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FGD1P98174 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FGD1P98174 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FGD1P98174 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FGD1P98174 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FGD1P98174 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FGD1P98174 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FGD1P98174 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FGD1P98174 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FGD1P98174 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FGD1P98174 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
FGD1P98174 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FGD1P98174 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FGD1P98174 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FGD1P98174 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
FGD1P98174 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FGD1P98174 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FGD1P98174 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FGD1P98174 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FGD1P98174 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FGD1P98174 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FGD1P98174 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FGD1P98174 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGD1P98174 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGD1P98174 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGD1P98174 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGD1P98174 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGD1P98174 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FGD1P98174 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FGD1P98174 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FGD1P98174 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FGD1P98174 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FGD1P98174 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FGD1P98174 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FGD1P98174 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FGD1P98174 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FGD1P98174 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FGD1P98174 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FGD1P98174 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FGD1P98174 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FGD1P98174 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms