Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT85P78386 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT85P78386 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT85P78386 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT85P78386 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT85P78386 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT85P78386 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT85P78386 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT85P78386 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT85P78386 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT85P78386 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT85P78386 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT85P78386 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT85P78386 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT85P78386 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT85P78386 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT85P78386 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT85P78386 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT85P78386 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT85P78386 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT85P78386 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT85P78386 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT85P78386 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KRT85P78386 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KRT85P78386 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
KRT85P78386 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KRT85P78386 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KRT85P78386 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KRT85P78386 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KRT85P78386 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KRT85P78386 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KRT85P78386 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KRT85P78386 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KRT85P78386 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT85P78386 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT85P78386 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT85P78386 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT85P78386 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT85P78386 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT85P78386 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT85P78386 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT85P78386 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT85P78386 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT85P78386 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT85P78386 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT85P78386 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KRT85P78386 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KRT85P78386 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KRT85P78386 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KRT85P78386 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
KRT85P78386 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT85P78386 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT85P78386 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT85P78386 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KRT85P78386 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT85P78386 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT85P78386 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT85P78386 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT85P78386 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT85P78386 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT85P78386 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT85P78386 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT85P78386 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT85P78386 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT85P78386 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT85P78386 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT85P78386 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT85P78386 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KRT85P78386 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KRT85P78386 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT85P78386 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT85P78386 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT85P78386 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT85P78386 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT85P78386 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT85P78386 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT85P78386 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT85P78386 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT85P78386 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT85P78386 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT85P78386 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT85P78386 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT85P78386 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT85P78386 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT85P78386 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT85P78386 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT85P78386 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT85P78386 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT85P78386 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT85P78386 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT85P78386 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT85P78386 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT85P78386 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT85P78386 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT85P78386 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT85P78386 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT85P78386 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT85P78386 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT85P78386 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT85P78386 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms