Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL38P63173 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL38P63173 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL38P63173 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL38P63173 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL38P63173 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL38P63173 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL38P63173 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL38P63173 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL38P63173 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL38P63173 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL38P63173 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL38P63173 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL38P63173 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL38P63173 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL38P63173 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL38P63173 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL38P63173 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL38P63173 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL38P63173 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL38P63173 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL38P63173 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL38P63173 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL38P63173 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL38P63173 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL38P63173 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL38P63173 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL38P63173 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPL38P63173 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL38P63173 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL38P63173 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL38P63173 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL38P63173 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL38P63173 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL38P63173 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL38P63173 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL38P63173 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL38P63173 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL38P63173 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL38P63173 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL38P63173 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL38P63173 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL38P63173 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL38P63173 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL38P63173 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL38P63173 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL38P63173 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL38P63173 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL38P63173 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL38P63173 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL38P63173 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL38P63173 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL38P63173 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL38P63173 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL38P63173 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL38P63173 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL38P63173 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL38P63173 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL38P63173 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL38P63173 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL38P63173 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL38P63173 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL38P63173 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL38P63173 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL38P63173 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL38P63173 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL38P63173 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL38P63173 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL38P63173 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL38P63173 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL38P63173 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL38P63173 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL38P63173 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL38P63173 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL38P63173 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL38P63173 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL38P63173 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL38P63173 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL38P63173 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPL38P63173 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL38P63173 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL38P63173 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL38P63173 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL38P63173 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL38P63173 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL38P63173 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL38P63173 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL38P63173 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL38P63173 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL38P63173 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL38P63173 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL38P63173 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL38P63173 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL38P63173 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL38P63173 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL38P63173 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL38P63173 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL38P63173 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL38P63173 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL38P63173 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms