Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPZ1P61923 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COPZ1P61923 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPZ1P61923 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPZ1P61923 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms