Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00315P59091 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00315P59091 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00315P59091 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00315P59091 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms