Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PEX5P50542 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX5P50542 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX5P50542 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX5P50542 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX5P50542 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PEX5P50542 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PEX5P50542 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PEX5P50542 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PEX5P50542 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PEX5P50542 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX5P50542 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX5P50542 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX5P50542 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX5P50542 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX5P50542 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PEX5P50542 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PEX5P50542 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PEX5P50542 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PEX5P50542 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX5P50542 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX5P50542 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX5P50542 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX5P50542 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX5P50542 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX5P50542 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX5P50542 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX5P50542 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX5P50542 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX5P50542 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX5P50542 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX5P50542 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX5P50542 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX5P50542 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX5P50542 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX5P50542 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX5P50542 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX5P50542 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX5P50542 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX5P50542 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX5P50542 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX5P50542 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX5P50542 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX5P50542 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX5P50542 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX5P50542 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX5P50542 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX5P50542 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX5P50542 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX5P50542 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX5P50542 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX5P50542 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX5P50542 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX5P50542 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX5P50542 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX5P50542 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX5P50542 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX5P50542 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX5P50542 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX5P50542 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX5P50542 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX5P50542 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX5P50542 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX5P50542 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX5P50542 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX5P50542 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX5P50542 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX5P50542 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX5P50542 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX5P50542 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX5P50542 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX5P50542 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX5P50542 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PEX5P50542 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PEX5P50542 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX5P50542 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX5P50542 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX5P50542 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX5P50542 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PEX5P50542 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX5P50542 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX5P50542 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX5P50542 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX5P50542 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX5P50542 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX5P50542 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX5P50542 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX5P50542 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX5P50542 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX5P50542 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX5P50542 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX5P50542 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX5P50542 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX5P50542 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX5P50542 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX5P50542 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX5P50542 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX5P50542 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX5P50542 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX5P50542 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms