Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSRP3P50461 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRP3P50461 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRP3P50461 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRP3P50461 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms