Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRPC1P48995 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRPC1P48995 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC1P48995 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC1P48995 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC1P48995 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms