Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RABIFP47224 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABIFP47224 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABIFP47224 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABIFP47224 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABIFP47224 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABIFP47224 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABIFP47224 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABIFP47224 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABIFP47224 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABIFP47224 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABIFP47224 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABIFP47224 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABIFP47224 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABIFP47224 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABIFP47224 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABIFP47224 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABIFP47224 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABIFP47224 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RABIFP47224 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABIFP47224 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABIFP47224 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABIFP47224 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABIFP47224 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABIFP47224 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABIFP47224 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABIFP47224 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABIFP47224 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABIFP47224 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABIFP47224 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABIFP47224 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABIFP47224 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABIFP47224 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RABIFP47224 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABIFP47224 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABIFP47224 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABIFP47224 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABIFP47224 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABIFP47224 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABIFP47224 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABIFP47224 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABIFP47224 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABIFP47224 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABIFP47224 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABIFP47224 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABIFP47224 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABIFP47224 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABIFP47224 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABIFP47224 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABIFP47224 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABIFP47224 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RABIFP47224 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABIFP47224 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABIFP47224 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABIFP47224 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABIFP47224 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RABIFP47224 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABIFP47224 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABIFP47224 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABIFP47224 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABIFP47224 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RABIFP47224 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABIFP47224 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABIFP47224 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABIFP47224 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABIFP47224 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABIFP47224 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABIFP47224 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABIFP47224 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABIFP47224 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABIFP47224 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABIFP47224 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABIFP47224 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABIFP47224 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABIFP47224 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABIFP47224 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RABIFP47224 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABIFP47224 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABIFP47224 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABIFP47224 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABIFP47224 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABIFP47224 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABIFP47224 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABIFP47224 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABIFP47224 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABIFP47224 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABIFP47224 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABIFP47224 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABIFP47224 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABIFP47224 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABIFP47224 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABIFP47224 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABIFP47224 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABIFP47224 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABIFP47224 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABIFP47224 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABIFP47224 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABIFP47224 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABIFP47224 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABIFP47224 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms