Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIA2P42262 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIA2P42262 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIA2P42262 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIA2P42262 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIA2P42262 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIA2P42262 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms