Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX19P40855 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX19P40855 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX19P40855 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX19P40855 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX19P40855 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX19P40855 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX19P40855 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX19P40855 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX19P40855 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX19P40855 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX19P40855 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX19P40855 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX19P40855 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX19P40855 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX19P40855 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX19P40855 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX19P40855 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX19P40855 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX19P40855 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX19P40855 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX19P40855 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX19P40855 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX19P40855 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX19P40855 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX19P40855 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX19P40855 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX19P40855 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX19P40855 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX19P40855 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX19P40855 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX19P40855 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX19P40855 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX19P40855 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX19P40855 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX19P40855 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX19P40855 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX19P40855 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX19P40855 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX19P40855 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX19P40855 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX19P40855 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX19P40855 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX19P40855 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX19P40855 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX19P40855 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX19P40855 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX19P40855 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX19P40855 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX19P40855 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX19P40855 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX19P40855 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX19P40855 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX19P40855 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX19P40855 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX19P40855 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX19P40855 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX19P40855 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX19P40855 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX19P40855 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX19P40855 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX19P40855 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX19P40855 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX19P40855 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX19P40855 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX19P40855 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX19P40855 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX19P40855 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX19P40855 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX19P40855 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX19P40855 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX19P40855 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX19P40855 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX19P40855 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX19P40855 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX19P40855 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX19P40855 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX19P40855 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX19P40855 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX19P40855 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX19P40855 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX19P40855 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX19P40855 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX19P40855 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX19P40855 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX19P40855 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX19P40855 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX19P40855 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX19P40855 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX19P40855 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX19P40855 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX19P40855 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX19P40855 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX19P40855 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX19P40855 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX19P40855 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX19P40855 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX19P40855 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX19P40855 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX19P40855 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms