Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR1AP35321 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPRR1AP35321 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPRR1AP35321 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR1AP35321 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms