Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFC2P35250 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFC2P35250 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC2P35250 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFC2P35250 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC2P35250 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC2P35250 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFC2P35250 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC2P35250 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC2P35250 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC2P35250 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC2P35250 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC2P35250 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC2P35250 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFC2P35250 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFC2P35250 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFC2P35250 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC2P35250 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC2P35250 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC2P35250 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC2P35250 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFC2P35250 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC2P35250 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC2P35250 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC2P35250 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC2P35250 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC2P35250 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFC2P35250 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC2P35250 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC2P35250 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFC2P35250 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFC2P35250 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFC2P35250 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFC2P35250 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFC2P35250 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC2P35250 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFC2P35250 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFC2P35250 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFC2P35250 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC2P35250 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC2P35250 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC2P35250 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFC2P35250 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC2P35250 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC2P35250 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFC2P35250 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC2P35250 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC2P35250 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC2P35250 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC2P35250 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC2P35250 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFC2P35250 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFC2P35250 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RFC2P35250 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFC2P35250 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFC2P35250 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFC2P35250 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RFC2P35250 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFC2P35250 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RFC2P35250 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RFC2P35250 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFC2P35250 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RFC2P35250 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFC2P35250 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFC2P35250 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFC2P35250 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFC2P35250 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFC2P35250 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFC2P35250 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFC2P35250 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFC2P35250 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RFC2P35250 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFC2P35250 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFC2P35250 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFC2P35250 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFC2P35250 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFC2P35250 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFC2P35250 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFC2P35250 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFC2P35250 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFC2P35250 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFC2P35250 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFC2P35250 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFC2P35250 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFC2P35250 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFC2P35250 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFC2P35250 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFC2P35250 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFC2P35250 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFC2P35250 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFC2P35250 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFC2P35250 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFC2P35250 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFC2P35250 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFC2P35250 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFC2P35250 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFC2P35250 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFC2P35250 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFC2P35250 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFC2P35250 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms