Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTNNA1P35221 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTNNA1P35221 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA1P35221 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNNA1P35221 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA1P35221 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms