Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RBP32927 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RBP32927 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSF2RBP32927 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSF2RBP32927 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSF2RBP32927 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSF2RBP32927 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF2RBP32927 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms