Protein–RNA interactions for Protein: P31040

SDHA, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAP31040 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAP31040 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAP31040 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAP31040 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAP31040 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAP31040 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAP31040 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAP31040 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAP31040 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAP31040 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAP31040 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAP31040 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAP31040 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAP31040 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAP31040 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAP31040 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAP31040 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAP31040 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAP31040 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAP31040 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHAP31040 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHAP31040 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHAP31040 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAP31040 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAP31040 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAP31040 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAP31040 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAP31040 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAP31040 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAP31040 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAP31040 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAP31040 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAP31040 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAP31040 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAP31040 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAP31040 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAP31040 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAP31040 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAP31040 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAP31040 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAP31040 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAP31040 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAP31040 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAP31040 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAP31040 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAP31040 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAP31040 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAP31040 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAP31040 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAP31040 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAP31040 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAP31040 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAP31040 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAP31040 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAP31040 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDHAP31040 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDHAP31040 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHAP31040 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHAP31040 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAP31040 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAP31040 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDHAP31040 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHAP31040 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHAP31040 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDHAP31040 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAP31040 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAP31040 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDHAP31040 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDHAP31040 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHAP31040 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHAP31040 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDHAP31040 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAP31040 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAP31040 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAP31040 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAP31040 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAP31040 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAP31040 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDHAP31040 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAP31040 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAP31040 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAP31040 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAP31040 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAP31040 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAP31040 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAP31040 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAP31040 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAP31040 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAP31040 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAP31040 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAP31040 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms