Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDX3P30048 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDX3P30048 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDX3P30048 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDX3P30048 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDX3P30048 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms