Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA4P25789 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMA4P25789 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA4P25789 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMA4P25789 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMA4P25789 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms