Protein–RNA interactions for Protein: P25021

HRH2, Histamine H2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH2P25021 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HRH2P25021 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HRH2P25021 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HRH2P25021 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HRH2P25021 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HRH2P25021 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HRH2P25021 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HRH2P25021 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HRH2P25021 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HRH2P25021 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HRH2P25021 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HRH2P25021 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HRH2P25021 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HRH2P25021 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HRH2P25021 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HRH2P25021 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HRH2P25021 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HRH2P25021 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HRH2P25021 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HRH2P25021 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HRH2P25021 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HRH2P25021 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HRH2P25021 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HRH2P25021 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HRH2P25021 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HRH2P25021 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HRH2P25021 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HRH2P25021 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HRH2P25021 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HRH2P25021 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HRH2P25021 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HRH2P25021 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HRH2P25021 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HRH2P25021 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HRH2P25021 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HRH2P25021 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HRH2P25021 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HRH2P25021 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HRH2P25021 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HRH2P25021 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HRH2P25021 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HRH2P25021 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HRH2P25021 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HRH2P25021 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HRH2P25021 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRH2P25021 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRH2P25021 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRH2P25021 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRH2P25021 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HRH2P25021 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRH2P25021 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRH2P25021 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRH2P25021 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HRH2P25021 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRH2P25021 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRH2P25021 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRH2P25021 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRH2P25021 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRH2P25021 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HRH2P25021 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRH2P25021 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRH2P25021 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HRH2P25021 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRH2P25021 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRH2P25021 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRH2P25021 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRH2P25021 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRH2P25021 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HRH2P25021 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HRH2P25021 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HRH2P25021 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HRH2P25021 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HRH2P25021 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HRH2P25021 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HRH2P25021 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HRH2P25021 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HRH2P25021 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HRH2P25021 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HRH2P25021 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HRH2P25021 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HRH2P25021 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HRH2P25021 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HRH2P25021 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HRH2P25021 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HRH2P25021 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HRH2P25021 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HRH2P25021 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HRH2P25021 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HRH2P25021 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HRH2P25021 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HRH2P25021 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HRH2P25021 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HRH2P25021 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HRH2P25021 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HRH2P25021 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HRH2P25021 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HRH2P25021 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HRH2P25021 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HRH2P25021 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HRH2P25021 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms