Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFAIP3P21580 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP3P21580 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFAIP3P21580 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP3P21580 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP3P21580 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP3P21580 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms