Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LIG1P18858 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LIG1P18858 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LIG1P18858 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LIG1P18858 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LIG1P18858 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LIG1P18858 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LIG1P18858 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LIG1P18858 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LIG1P18858 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LIG1P18858 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LIG1P18858 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LIG1P18858 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LIG1P18858 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LIG1P18858 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LIG1P18858 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LIG1P18858 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LIG1P18858 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LIG1P18858 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LIG1P18858 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LIG1P18858 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LIG1P18858 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LIG1P18858 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LIG1P18858 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LIG1P18858 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LIG1P18858 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LIG1P18858 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LIG1P18858 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LIG1P18858 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LIG1P18858 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LIG1P18858 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LIG1P18858 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LIG1P18858 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LIG1P18858 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LIG1P18858 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LIG1P18858 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LIG1P18858 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LIG1P18858 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LIG1P18858 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LIG1P18858 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LIG1P18858 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LIG1P18858 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LIG1P18858 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LIG1P18858 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LIG1P18858 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LIG1P18858 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LIG1P18858 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LIG1P18858 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LIG1P18858 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LIG1P18858 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LIG1P18858 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LIG1P18858 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LIG1P18858 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LIG1P18858 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LIG1P18858 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LIG1P18858 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LIG1P18858 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LIG1P18858 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LIG1P18858 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LIG1P18858 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LIG1P18858 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LIG1P18858 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LIG1P18858 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LIG1P18858 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LIG1P18858 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LIG1P18858 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LIG1P18858 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LIG1P18858 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LIG1P18858 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LIG1P18858 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LIG1P18858 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LIG1P18858 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LIG1P18858 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LIG1P18858 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LIG1P18858 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LIG1P18858 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LIG1P18858 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LIG1P18858 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LIG1P18858 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LIG1P18858 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LIG1P18858 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LIG1P18858 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LIG1P18858 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LIG1P18858 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LIG1P18858 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LIG1P18858 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LIG1P18858 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LIG1P18858 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LIG1P18858 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LIG1P18858 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LIG1P18858 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LIG1P18858 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LIG1P18858 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LIG1P18858 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LIG1P18858 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LIG1P18858 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LIG1P18858 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LIG1P18858 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LIG1P18858 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LIG1P18858 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms