Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBP11277 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBP11277 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBP11277 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBP11277 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBP11277 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPTBP11277 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPTBP11277 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBP11277 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBP11277 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBP11277 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBP11277 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBP11277 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBP11277 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBP11277 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBP11277 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBP11277 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBP11277 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBP11277 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBP11277 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBP11277 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBP11277 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBP11277 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBP11277 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBP11277 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPTBP11277 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBP11277 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBP11277 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBP11277 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBP11277 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBP11277 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBP11277 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBP11277 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBP11277 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBP11277 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBP11277 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBP11277 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBP11277 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBP11277 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBP11277 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBP11277 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBP11277 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBP11277 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBP11277 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBP11277 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBP11277 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBP11277 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBP11277 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBP11277 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBP11277 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBP11277 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBP11277 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBP11277 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPTBP11277 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBP11277 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBP11277 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBP11277 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBP11277 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBP11277 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBP11277 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBP11277 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBP11277 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBP11277 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBP11277 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBP11277 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBP11277 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTBP11277 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBP11277 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBP11277 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBP11277 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTBP11277 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTBP11277 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTBP11277 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBP11277 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTBP11277 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTBP11277 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTBP11277 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBP11277 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBP11277 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBP11277 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBP11277 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBP11277 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBP11277 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBP11277 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBP11277 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBP11277 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms