Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB1P08183 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB1P08183 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCB1P08183 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB1P08183 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms