Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT1P04264 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT1P04264 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT1P04264 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT1P04264 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT1P04264 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT1P04264 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT1P04264 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT1P04264 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT1P04264 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT1P04264 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT1P04264 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT1P04264 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT1P04264 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT1P04264 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT1P04264 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT1P04264 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT1P04264 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT1P04264 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT1P04264 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT1P04264 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT1P04264 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT1P04264 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT1P04264 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT1P04264 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT1P04264 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT1P04264 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT1P04264 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT1P04264 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT1P04264 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT1P04264 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT1P04264 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT1P04264 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT1P04264 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT1P04264 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT1P04264 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT1P04264 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT1P04264 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT1P04264 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT1P04264 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT1P04264 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT1P04264 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT1P04264 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT1P04264 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT1P04264 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT1P04264 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT1P04264 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT1P04264 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT1P04264 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT1P04264 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT1P04264 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT1P04264 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT1P04264 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT1P04264 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT1P04264 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT1P04264 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT1P04264 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT1P04264 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT1P04264 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT1P04264 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT1P04264 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT1P04264 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT1P04264 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT1P04264 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT1P04264 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT1P04264 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT1P04264 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT1P04264 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT1P04264 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT1P04264 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT1P04264 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT1P04264 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT1P04264 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT1P04264 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT1P04264 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT1P04264 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT1P04264 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT1P04264 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT1P04264 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT1P04264 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT1P04264 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT1P04264 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT1P04264 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT1P04264 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT1P04264 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT1P04264 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT1P04264 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT1P04264 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT1P04264 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT1P04264 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT1P04264 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT1P04264 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT1P04264 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT1P04264 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT1P04264 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT1P04264 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT1P04264 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT1P04264 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT1P04264 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT1P04264 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1255.2 ms