Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MT-ND1P03886 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MT-ND1P03886 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MT-ND1P03886 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MT-ND1P03886 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MT-ND1P03886 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms