Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AFPP02771 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFPP02771 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFPP02771 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFPP02771 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AFPP02771 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFPP02771 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AFPP02771 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AFPP02771 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFPP02771 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFPP02771 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AFPP02771 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AFPP02771 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFPP02771 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFPP02771 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFPP02771 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AFPP02771 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AFPP02771 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AFPP02771 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AFPP02771 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AFPP02771 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AFPP02771 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AFPP02771 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
AFPP02771 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFPP02771 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFPP02771 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFPP02771 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFPP02771 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFPP02771 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFPP02771 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFPP02771 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFPP02771 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFPP02771 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFPP02771 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFPP02771 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFPP02771 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFPP02771 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFPP02771 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFPP02771 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFPP02771 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFPP02771 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFPP02771 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFPP02771 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFPP02771 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFPP02771 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFPP02771 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
AFPP02771 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFPP02771 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFPP02771 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AFPP02771 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFPP02771 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFPP02771 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFPP02771 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFPP02771 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFPP02771 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFPP02771 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFPP02771 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFPP02771 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFPP02771 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFPP02771 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFPP02771 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFPP02771 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFPP02771 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AFPP02771 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFPP02771 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFPP02771 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFPP02771 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
AFPP02771 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFPP02771 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFPP02771 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFPP02771 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFPP02771 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFPP02771 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFPP02771 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFPP02771 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28■■■□□ 2.07
AFPP02771 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFPP02771 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AFPP02771 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFPP02771 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFPP02771 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFPP02771 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFPP02771 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFPP02771 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFPP02771 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFPP02771 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFPP02771 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFPP02771 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFPP02771 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFPP02771 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFPP02771 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFPP02771 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFPP02771 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFPP02771 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFPP02771 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFPP02771 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFPP02771 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFPP02771 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFPP02771 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFPP02771 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
AFPP02771 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms