Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL4A1P02462 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL4A1P02462 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
COL4A1P02462 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
COL4A1P02462 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
COL4A1P02462 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
COL4A1P02462 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
COL4A1P02462 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms